如果楼下店里存在问题，可以采取以下措施：
投诉举报
向环保部门投诉，反映店铺的油烟、噪音等问题。
向工商部门投诉，尤其是针对未领取营业执照擅自营业的行为。
向公安部门报警，特别是涉及社会生活噪声污染的行为。
协商解决
首先可以与店铺负责人进行沟通，表达自己的不满和要求，尝试协商解决问题。
如果店铺负责人不配合，可以请物业公司或居委会等第三方进行调解。
法律途径
如果投诉举报无效，可以向法院提起诉讼，要求店铺承担相应的法律责任。
在诉讼过程中，需要提供证据证明店铺的扰民行为及其造成的损害后果。
自我防护
如果店铺的扰民行为严重影响到自己的生活，可以采取一些自我保护措施，如安装隔音窗、悬挂窗帘、关闭门窗等。
其他部门
向规划部门投诉，针对擅自变更房屋使用性质的行为。
向城管执法部门投诉，针对店铺的违规行为。
建议首先尝试与店铺负责人协商，如果无法达成一致，再考虑向相关部门投诉或提起诉讼。在整个过程中，保留好相关证据，以便在需要时能够提供有力的支持。